RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484647.1

TIMM17A-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, human

TSL 2

Gene TIMM17A, Length 661 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM17A-204	ENST00000484647	DAB1	O75553	588 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PIAS2	O75928	621 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PRNP	P04156	253 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	RHOC	P08134	193 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CKMT1A	P12532	417 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	KRT9	P35527	623 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CXCR3	P49682	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CLDN2	P57739	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TLE3	Q04726	772 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	BMF	Q96LC9	184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	NPY6R	Q99463	290 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	OPA1	O60313	960 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	MPO	P05164	745 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	MYF5	P13349	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PON1	P27169	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CLCN1	P35523	988 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647		Q6ZSR6	202 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ATM	Q13315	3056 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SCAMP1	O15126	338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	LEFTY1	O75610	366 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ENDOD1	O94919	500 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	F9	P00740	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	GP1BA	P07359	652 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ALPPL2	P10696	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	OR1E1	P30953	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SULT1E1	P49888	294 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	CXADR	P78310	365 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	LGMN	Q99538	433 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM17A-204	ENST00000484647	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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