RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 I6L893 689 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 J3QKU1 62 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 K7ESM1 405 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 RAD51BO15315 384 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SNAP91O60641 907 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 CSO75390 466 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 GRAP2O75791 330 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 PIAS2O75928 621 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 NEBLO76041 1014 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 TGM2P21980 687 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNA3P32297 505 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 NUDT1P36639 197 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ACADSBP45954 432 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 LSSP48449 732 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 GABREP78334 506 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 FGL2Q14314 439 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ARTNQ5T4W7 220 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 GJB7Q6PEY0 223 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZSR6 202 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 HORMAD1Q86X24 394 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA20Q8TB22 786 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 STK32AQ8WU08 396 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 TTC9Q92623 222 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 CALN1Q9BXU9 219 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 THAP9Q9H5L6 903 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 PREBQ9HCU5 417 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 KLF15Q9UIH9 416 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 POM121BA6NF01 834 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SCAMP1O15126 338 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KLK10O43240 276 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PAGE1O75459 146 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ENDOD1O94919 500 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KRT5P13647 590 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 BMP6P22004 513 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 RRM1P23921 792 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CDK17Q00537 523 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 APBA1Q02410 837 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GCNT1Q02742 428 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC63Q05C16 580 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 FZD2Q14332 565 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 C5orf22Q49AR2 442 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ALFQ53S48 1182 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 LINGO4Q6UY18 593 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 RNF34Q969K3 372 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GSDMAQ96QA5 445 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MED15Q96RN5 788 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CPXM1Q96SM3 734 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SIK2Q9H0K1 926 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 RMND1Q9NWS8 449 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DDIT4Q9NX09 232 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 VPS28Q9UK41 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.64□□□□□ -1.03
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