RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC14Q96N46 770 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MXD3Q9BW11 206 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.05□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 COL4A1P02462 1669 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC4O15439 1325 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY2A6NKD2 308 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 F5H697 171 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ANP32CO43423 234 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TULP3O75386 442 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ELANEP08246 267 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY3P0CV98 308 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY8P0CW00 308 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PNPLA4P41247 253 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 NLRP5P59047 1200 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPY1Q01534 308 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MC1RQ01726 317 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKCZQ05513 592 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 WTAPQ15007 396 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 C16orf89Q6UX73 402 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC39CQ8N584 583 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ARRDC3Q96B67 414 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PERPQ96FX8 193 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 RADILQ96JH8 1075 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MROH8Q9H579 483 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 GBF1Q92538 1859 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.04□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MASP2O00187 686 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF14O43557 240 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF10O60809 474 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MFAP3LO75121 409 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF623O75123 536 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 GUCY1B2O75343 617 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PDHA1P08559 390 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 WEE2P0C1S8 567 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXD10P28358 340 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL3P36405 182 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 BFSP2Q13515 415 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNJ12Q14500 433 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf99Q6UX52 265 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZSN1 163 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SZRD1Q7Z422 152 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGSQ96S52 555 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX101Q9BY14 249 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 MRGBPQ9NV56 204 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 GABRQQ9UN88 632 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.03□□□□□ -1.44
STRADBP1-201ENST00000478954 TECTAO75443 2155 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADBP1-201ENST00000478954 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.02□□□□□ -1.45
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PS29 197 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms