RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA3BQ13214 749 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 WASH4PA8MWX3 477 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 CASP14P31944 242 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 GRIA4P48058 902 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 METAP1P53582 386 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 RACK1P63244 317 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 CNTN1Q12860 1018 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 CACNA1EQ15878 2313 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 TNKS2Q9H2K2 1166 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 DYRK4Q9NR20 520 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 IL36AQ9UHA7 158 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1B0GVT2 93 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 KDELR3O43731 214 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PRPSAP2O60256 369 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CER1O95813 267 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CTSLP07711 333 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 DNA2P51530 1060 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ACAP1Q15027 740 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NFKBIBQ15653 356 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CARD16Q5EG05 197 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PLPP6Q8IY26 295 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 SKA1Q96BD8 255 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R16AQ96I34 528 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ORAI3Q9BRQ5 295 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 SPTBN2O15020 2390 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 C10orf142B7Z368 130 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PLK4O00444 970 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 GJB3O75712 270 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CD160O95971 181 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NUDT1P36639 197 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 TPI1P60174 286 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 HLA-BQ31612 363 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 POM121L1PQ3SYA9 428 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ARSIQ5FYB1 569 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 AGBL4Q5VU57 503 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CHST14Q8NCH0 376 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 HEPHQ9BQS7 1158 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 GAREM1Q9H706 876 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF883P0CG24 379 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 MIPP30301 263 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 BNC1Q01954 994 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM14Q14142 442 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PARP15Q460N3 678 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PIP4P1Q86T03 277 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 DEFB124Q8NES8 71 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM7Q9C029 511 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PREBQ9HCU5 417 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 A0A087X0T9 212 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 LATO43561 262 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 BUB1O43683 1085 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 LEFTY1O75610 366 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 FAM228BP0C875 321 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CD59P13987 128 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 PCK1P35558 622 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 KIF19Q2TAC6 998 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 NEK5Q6P3R8 708 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM69Q86WT6 500 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPN4-208ENST00000460289 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms