RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 PLOD2O00469 737 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRIM24O15164 1050 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DLX3O60479 287 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRPA1O75762 1119 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CABYRO75952 493 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PGK1P00558 417 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 APOA4P06727 396 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 IMPDH2P12268 514 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CYP2B6P20813 491 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FGFR3P22607 806 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GABRB3P28472 473 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ADORA2BP29275 332 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MATKP42679 507 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GLRBP48167 497 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SULT1E1P49888 294 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 BCAT1P54687 386 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CTBSQ01459 385 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 POU5F1BQ06416 359 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PTK2BQ14289 1009 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ANO4Q32M45 955 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 Q3C1V9 767 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MTX3Q5HYI7 312 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FIBCD1Q8N539 461 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RNF169Q8NCN4 708 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CCNYQ8ND76 341 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LZICQ8WZA0 190 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NT5C3BQ969T7 300 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SPATA33Q96N06 139 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GPR78Q96P69 363 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TASP1Q9H6P5 420 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 OLAHQ9NV23 265 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SETD4Q9NVD3 440 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MID2Q9UJV3 735 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.7□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 E7ENX8 843 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM72CH0Y354 149 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FBP2O00757 339 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 MAGEB3O15480 346 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 HBP1O60381 514 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DAB1O75553 588 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CSPG5O95196 566 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 VTNP04004 478 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CYP2C8P10632 490 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NDST2P52849 883 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RALGDSQ12967 914 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ZBTB17Q13105 803 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SEMA3BQ13214 749 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ZNF460Q14592 562 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CYTH1Q15438 398 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ADRM1Q16186 407 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DGKDQ16760 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 KLHL35Q6PF15 583 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRIM74Q86UV6 250 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 TRIM73Q86UV7 250 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM72BQ86X60 149 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DEFB106AQ8N104 65 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RIN3Q8TB24 985 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 FAM110BQ8TC76 370 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 DPF3Q92784 378 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 EME1Q96AY2 570 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 KLRG1Q96E93 195 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RANBP9Q96S59 729 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SLC29A1Q99808 456 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 APOL2Q9BQE5 337 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 GBA3Q9H227 469 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.69□□□□□ -1.34
RARB-204ENST00000458646 RHOJQ9H4E5 214 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms