RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 LPPQ93052 612 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PHF21BQ96EK2 531 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HSFY1Q96LI6 401 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 IPPQ9Y573 584 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MAGEB16A2A368 324 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 YDJCA8MPS7 323 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CLOCKO15516 846 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BANF1O75531 89 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ALDH1A2O94788 518 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CD52P31358 61 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GABRB2P47870 512 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NR2C2P49116 596 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MOGSQ13724 837 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 LBX2Q6XYB7 198 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 LRRC15Q8TF66 581 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RBBP8Q99708 897 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RTKNQ9BST9 563 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 WDR41Q9HAD4 459 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TMEM165Q9HC07 324 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HPS4Q9NQG7 708 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MATN2O00339 956 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ARHGEF9O43307 516 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 AMHP03971 560 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NPR3P17342 541 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FASP25445 335 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PRIM2P49643 509 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NME5P56597 212 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DEFA1P59665 94 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DEFA3P59666 94 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NOMO3P69849 1222 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLD3Q8IV08 490 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FAM162AQ96A26 154 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLK2Q9NYY3 685 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDH22Q9UJ99 828 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HLA-DPA1P20036 260 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLD1Q13393 1074 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MPP2Q14168 576 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GRTP1Q5TC63 336 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SELENONQ9NZV5 590 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 F8W810 466 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ARIH2O95376 493 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PEX2P28328 305 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CACHD1Q5VU97 1274 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ISLR2Q6UXK2 745 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 APBA2Q99767 749 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CAPN10Q9HC96 672 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 WDR27A2RRH5 827 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ASLP04424 464 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SNHG28P0DPA3 235 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FKBP1BP68106 108 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HPCAP84074 193 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 STARD3Q14849 445 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TBCELQ5QJ74 424 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ERAP2Q6P179 960 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DHFR2Q86XF0 187 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SYT17Q9BSW7 474 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DYTNA2CJ06 578 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PEX10O60683 326 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CCNE2O96020 404 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CHRNB2P17787 502 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GPC1P35052 558 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HALP42357 657 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms