RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 VAV1P15498 845 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PRCPP42785 496 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ACADVLP49748 655 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBX4P57082 545 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF445P59923 1031 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PPP2CBP62714 309 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PPP2CAP67775 309 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CST6Q15828 149 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 USP30Q70CQ3 517 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MFN1Q8IWA4 741 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 APCDD1Q8J025 514 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 STK40Q8N2I9 435 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TTC39CQ8N584 583 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EID2Q8N6I1 236 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GANCQ8TET4 914 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA1Q92805 767 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRN2Q92932 1015 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC39A13Q96H72 371 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA32Q96LK8 384 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PRORYQ9H606 182 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 HESX1Q9UBX0 185 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MYLKQ15746 1914 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CETN3O15182 167 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 IRAK2O43187 625 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF202O95125 648 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LTFP02788 710 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ITGAVP06756 1048 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SETSIPP0DME0 302 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CD38P28907 300 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC8A1P32418 973 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DRD3P35462 400 aa6.76□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 ABCG1P45844 678 aa6.76□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 ADPRHP54922 357 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 C21orf59P57076 290 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC8A3P57103 927 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NXPH1P58417 271 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ATP11AP98196 1134 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PNOCQ13519 176 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CNGA2Q16280 664 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF6Q58WW2 860 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 HES3Q5TGS1 186 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PCSK4Q6UW60 755 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.76□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 IRGQQ8WZA9 623 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35C1Q96A29 364 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 AZIN2Q96A70 460 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MIS12Q9H081 205 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 BPTFQ12830 3046 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 E9PAM4 449 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 M0QYV0 167 aa6.76□□□□□ -1.33
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