RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-211ENST00000425989 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-211ENST00000425989 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-211ENST00000425989 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-211ENST00000425989 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-211ENST00000425989 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 J3KR12 359 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 AGPSO00116 658 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RASGRF2O14827 1237 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINF2P08697 491 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GJA1P17302 382 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NFKB1P19838 968 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CA4P22748 312 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PSMB4P28070 264 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GAD2Q05329 585 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB17Q13105 803 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 USP4Q13107 963 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF235Q14590 738 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PDGFRLQ15198 375 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 BBS9Q3SYG4 887 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LGSNQ5TDP6 509 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RANBP10Q6VN20 620 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MFN1Q8IWA4 741 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SPOCK2Q92563 424 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TADA1Q96BN2 335 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CYTH2Q99418 400 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 IGFLR1Q9H665 355 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PDFQ9HBH1 243 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO10Q9UK96 956 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQ67 120 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CDH16O75309 829 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM63AO94886 807 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NFATC1O95644 943 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ADH1CP00326 375 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CPP00450 1065 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 POLBP06746 335 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ALADP13716 330 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 STX2P32856 288 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ACVRL1P37023 503 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ELK3P41970 407 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ITKQ08881 620 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HYAL1Q12794 435 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NAB1Q13506 487 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GRM3Q14832 879 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PCID2Q5JVF3 399 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 EMC10Q5UCC4 262 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ITFG1Q8TB96 612 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PEX13Q92968 403 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 WBP2Q969T9 261 aa9.76□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 ALG14Q96F25 216 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf72Q96LT7 481 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ASB16Q96NS5 453 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MGME1Q9BQP7 344 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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