RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDF3Q9NR23 364 aa17.25■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A13Q9UJS0 675 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 HS3ST2Q9Y278 367 aa17.25■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa17.25■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX24Q9Y343 169 aa17.24■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM24O15164 1050 aa17.23■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-DQB2P05538 268 aa17.23■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM215Q68D42 235 aa17.23■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MSANTD3Q96H12 275 aa17.23■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.23■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA6BA6NDN3 693 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMCC1O94876 653 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL18O95568 372 aa17.22■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZP2Q05996 745 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDSRQ06136 332 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 E2F5Q15329 346 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYTH1Q15438 398 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELF2Q15723 593 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.22■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 P2RY13Q9BPV8 354 aa17.22■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP44Q9C0F1 390 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A51Q9H1U9 297 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPC1Q9H2F5 836 aa17.22■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ELOVL2Q9NXB9 296 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRHL1Q9NZI5 618 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESYT3A0FGR9 886 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 E7EVH7 732 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA9O76027 345 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 KAT7O95251 611 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT-CO1P00395 513 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 APODP05090 189 aa17.21■□□□□ 0.35
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