RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 WSCD1Q658N2 575 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ITFG1Q8TB96 612 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CASP10Q92851 521 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH10P35580 1976 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PLIN3O60664 434 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TFEBP19484 476 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EPS8Q12929 822 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP1A4Q13733 1029 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 15.6
CTDSP2-201ENST00000398073 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NDNQ99608 321 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DYTNA2CJ06 578 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKZQ13574 1117 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 POTEHQ6S545 545 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SETD9Q8NE22 299 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPN8A6NHC0 703 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PRRG1O14668 218 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GJB1P08034 283 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 VCLP18206 1134 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ADORA2AP29274 412 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OR1E1P30953 314 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC103Q8IW40 242 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HES2Q9Y543 173 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RIPK3Q9Y572 518 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM63AO94886 807 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH1A1P00352 501 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 AIF1P55008 147 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GDF10P55107 478 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 BNIP2Q12982 314 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MTA1Q13330 715 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RORBQ92753 470 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.58■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 BTN3A1O00481 513 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD51BO15315 384 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BDNFP23560 247 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TCEAL1Q15170 157 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PFKFB4Q16877 469 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SPASTQ9UBP0 616 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PLSCR1O15162 318 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX11AO75192 247 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT75O95678 551 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMB9P28065 219 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXD10P28358 340 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXL18Q96ME1 805 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TCF12Q99081 682 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DMTF1Q9Y222 760 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GCATO75600 419 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 OCM2P0CE71 109 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KLRC2P26717 231 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB27AP51159 221 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SVOPQ8N4V2 548 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HGH1Q9BTY7 390 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRMOQ9BU70 441 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 COL6A2P12110 1019 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CTBP1Q13363 440 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms