RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN3P26045 913 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GCAP28676 217 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 OR1D2P34982 312 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINB6P35237 376 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ACTN2P35609 894 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MMP13P45452 471 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TNK2Q07912 1038 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TAF10Q12962 218 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PARP6Q2NL67 630 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC38Q502W7 563 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD16Q68DU8 428 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CYS1Q717R9 158 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PDIK1LQ8N165 341 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 VPS52Q8N1B4 723 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM199Q8N511 208 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MAML1Q92585 1016 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO32Q969P5 355 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 AZIN2Q96A70 460 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CENPTQ96BT3 561 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB9Q96C00 473 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf72Q96LT7 481 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 VAT1Q99536 393 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LGMNQ99538 433 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ALG2Q9H553 416 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SPG21Q9NZD8 308 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 COX16Q9P0S2 106 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BRCA2P51587 3418 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 E9PAM4 449 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RNF103O00237 685 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CDH16O75309 829 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SOAT2O75908 522 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RAG1P15918 1043 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCNCP24863 283 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 EPHB2P29323 1055 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPM1AP35813 382 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPP3CCP48454 512 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IFNAR2P48551 515 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TUBP50607 506 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NDST2P52849 883 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LBX1P52954 281 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC18A1P54219 525 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARPP19P56211 112 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TBX4P57082 545 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPP2R2AP63151 447 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 COG7P83436 770 aa6.16□□□□□ -1.42
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