RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 E2F8A0AVK6 867 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CFAP73A6NFT4 308 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLIN3O60664 434 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGEA12P43365 314 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARFIP2P53365 341 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RING1Q06587 406 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHL29Q96CT2 875 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C7orf26Q96N11 449 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KLC4Q9NSK0 619 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DRGXA6NNA5 263 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UNC5CO95185 931 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRKCGP05129 697 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINB8P50452 374 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNJ2P63252 427 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OCRLQ01968 901 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 USP41Q3LFD5 358 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SP110Q9HB58 689 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NT5MQ9NPB1 228 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DONSONQ9NYP3 566 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTRRQ9UBK8 725 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EFEMP2O95967 443 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR1D2P34982 312 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHRNA4P43681 627 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GJA8P48165 433 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RENBPP51606 427 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNQ1P51787 676 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCSK7Q16549 785 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 INSCQ1MX18 579 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PSMG2Q969U7 264 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF358Q9NW07 568 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PROCP04070 461 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 WNT3AP56704 352 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAXP61244 160 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TLE2Q04725 743 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TRIM60Q495X7 471 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MARC1Q5VT66 337 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KDELC1Q6UW63 502 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RANBP10Q6VN20 620 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ASRGL1Q7L266 308 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FATE1Q969F0 183 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CWH43Q9H720 699 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HEY2Q9UBP5 337 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TIMM44O43615 452 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TACR2P21452 398 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITKQ08881 620 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DLG2Q15700 870 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DBN1Q16643 649 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms