RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	MMRN1	Q13201	1228 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	DPYSL3	Q14195	570 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	USP30	Q70CQ3	517 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CHST14	Q8NCH0	376 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	GPR174	Q9BXC1	333 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		32.42	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991		A0A1W2PP55	124 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	BUB1	O43683	1085 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	C5AR1	P21730	350 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ACSL1	P33121	698 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	MPL	P40238	635 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CREB5	Q02930	508 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC6	Q16204	474 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC114	Q96M63	670 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PDF	Q9HBH1	243 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		32.41	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	LRP3	O75074	770 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CHRNA3	P32297	505 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	GANC	Q8TET4	914 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		32.4	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991		J3KR12	359 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF103	O00237	685 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PRAMEF11	O60813	436 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	TMCC1	O94876	653 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	DRD3	P35462	400 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF33A	Q06730	810 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CARD16	Q5EG05	197 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	LZTR1	Q8N653	840 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	KCTD6	Q8NC69	237 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
OLFM1-208	ENST00000392991	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	DFFA	O00273	331 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	COMT	P21964	271 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC1A1	P43005	524 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	DNA2	P51530	1060 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	PDK2	Q15119	407 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	RAPGEF5	Q92565	580 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF670	Q9BS34	389 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CALN1	Q9BXU9	219 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	FZD4	Q9ULV1	537 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		32.38	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	PLK4	O00444	970 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ITPKA	P23677	461 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	GSDMD	P57764	484 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	PLPP6	Q8IY26	295 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	TMIE	Q8NEW7	156 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	FAF2	Q96CS3	445 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	OMD	Q99983	421 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SGK2	Q9HBY8	427 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	IL36A	Q9UHA7	158 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	NUP205	Q92621	2012 aa		32.37	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SEMA4F	O95754	770 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	GSR	P00390	522 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	VAV2	P52735	878 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CSRP2	Q16527	193 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC38	Q5VT99	294 aa		32.36	■■■□□ 2.77
OLFM1-208	ENST00000392991	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		32.36	■■■□□ 2.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms