RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SYT12Q8IV01 421 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 BBS4Q96RK4 519 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CYP7B1O75881 506 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NAA20P61599 178 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPT1Q15389 498 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 QRFPRQ96P65 431 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 APOL4Q9BPW4 351 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CRY2Q49AN0 593 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 STK32AQ8WU08 396 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQJ8 604 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALT5O43286 388 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MTA2O94776 668 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SLURP2P0DP57 97 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TNNI3P19429 210 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB9P28065 219 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TTPAP49638 278 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SKP1P63208 163 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ARCQ7LC44 396 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ITFG1Q8TB96 612 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MYLPFQ96A32 169 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SHBGP04278 402 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 HPCAL1P37235 193 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FAM187BQ17R55 369 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ARSHQ5FYA8 562 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA3CQ99985 751 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP8O95379 198 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SVOPQ8N4V2 548 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF398Q8TD17 642 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 VAV3Q9UKW4 847 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ATRNO75882 1429 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PEX1O43933 1283 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY1B2O75343 617 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GOT1P17174 413 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 XRCC4Q13426 336 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 UGCGQ16739 394 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ALFQ53S48 1182 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ATL1Q8WXF7 558 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NLNQ9BYT8 704 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CEP44Q9C0F1 390 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 STMN3Q9NZ72 180 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KLQ9UEF7 1012 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO10Q9UK96 956 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINI2O75830 405 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 LRPAP1P30533 357 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CASP12Q6UXS9 341 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TALDO1P37837 337 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TMCO1Q9UM00 188 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 INVSQ9Y283 1065 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 A8MX80 341 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 PDK4Q16654 411 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF25Q93038 417 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 TFEBP19484 476 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-203ENST00000366687 GRIK3Q13003 919 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms