RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TP73O15350 636 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 APRTP07741 180 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 GDI1P31150 447 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ARF5P84085 180 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SLC12A1Q13621 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF235Q14590 738 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LINGO4Q6UY18 593 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ECT2Q9H8V3 914 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HPS4Q9NQG7 708 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 GGA2Q9UJY4 613 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CACNG3O60359 315 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LMAN1P49257 510 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HTR4Q13639 388 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 BBS5Q8N3I7 341 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CPA6Q8N4T0 437 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TTC8Q8TAM2 541 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ZMPSTE24O75844 475 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM153BP0C7A2 387 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ITKQ08881 620 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 NR1H3Q13133 447 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SEMA5AQ13591 1074 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 KCNJ11Q14654 390 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM153CQ494X1 144 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 HOOK3Q86VS8 718 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TEX26Q8N6G2 289 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 EXOC4Q96A65 974 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 LMLNQ96KR4 655 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GLOD4Q9HC38 313 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM50BQ9Y247 325 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ANHXE9PGG2 379 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM24O15164 1050 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CHADO15335 359 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM63AO94886 807 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PLK1P53350 603 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MAXP61244 160 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 RUNX3Q13761 415 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FUT11Q495W5 492 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 RETSATQ6NUM9 610 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD7Q92527 254 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ACDQ96AP0 544 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SEPT3Q9UH03 358 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SLC34A2O95436 690 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 IL9P15248 144 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 DGKGP49619 791 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PRPSAP1Q14558 356 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC25Q86WR0 208 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 C12orf40Q86WS4 652 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 BRD9Q9H8M2 597 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 COL4A3Q01955 1670 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 EMBQ6PCB8 327 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 AHI1Q8N157 1196 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PWWP2AQ96N64 755 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 UBP1Q9NZI7 540 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 SMAPO00193 183 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TULP3O75386 442 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TMCC1O94876 653 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 MAGEA6P43360 314 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 AAK1Q2M2I8 961 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 PGBD5Q8N414 524 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 FCRL5Q96RD9 977 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-201ENST00000360046 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.23■■□□□ 1.15
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