RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 AVILO75366 819 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CLDN11O75508 207 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 NEBLO76041 1014 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN2P17706 415 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 EPHA5P54756 1037 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CHST9Q7L1S5 443 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SP110Q9HB58 689 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 AP2A1O95782 977 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 INHBAP08476 426 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 EPCAMP16422 314 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 KRT4P19013 534 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SPATA21Q7Z572 469 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CNTD1Q8N815 330 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.48■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TM9SF1O15321 606 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PSMD3O43242 534 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 XYLBO75191 536 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 RFPL2O75678 378 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.871e-8■■■□□ 14.6
SUMO3-201ENST00000332859 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SERINC3Q13530 473 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PDK4Q16654 411 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 Q6ZNB5 142 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 LEMD2Q8NC56 503 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GLOD4Q9HC38 313 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.47■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 A0A1B0GVM2 712 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CACNG3O60359 315 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 FAM155BO75949 473 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GSTA1P08263 222 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GJA1P17302 382 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PRKCHP24723 683 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 FOXN2P32314 431 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 RENBPP51606 427 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 IL10RBQ08334 325 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 HHATQ5VTY9 493 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CFAP36Q96G28 342 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 FCRL5Q96RD9 977 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 MAGEH1Q9H213 219 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GREM1O60565 184 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TSPAN3O60637 253 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 PEX11BO96011 259 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 MT-ND3P03897 115 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GRIA1P42261 906 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 GNA12Q03113 381 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 KCTD11Q693B1 232 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 BANPQ8N9N5 519 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.46■□□□□ 0.87
SUMO3-201ENST00000332859 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 J3KR12 359 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 ANXA9O76027 345 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 C1QAP02745 245 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 HLA-DQB2P05538 268 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 PBX2P40425 430 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 SGSHP51688 502 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 ZXDBP98169 803 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 LGSNQ5TDP6 509 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 MARC1Q5VT66 337 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.45■□□□□ 0.86
SUMO3-201ENST00000332859 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms