RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 FAAP100Q0VG06 881 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 DNERQ8NFT8 737 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TEKT5Q96M29 485 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PHF11Q9UIL8 331 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 OGTO15294 1046 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ORC5O43913 435 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 AKT1P31749 480 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RCVRNP35243 200 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LIN54Q6MZP7 749 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NEK6Q9HC98 313 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 DHRS12A0PJE2 317 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TGDSO95455 350 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP8P85298 464 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GNA12Q03113 381 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 BST1Q10588 318 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 BNIP3Q12983 259 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GGA3Q9NZ52 723 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 AK9Q5TCS8 1911 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TBX1O43435 398 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 KIZQ2M2Z5 673 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TBX20Q9UMR3 447 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM205CA6NFA0 338 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CRTAMO95727 393 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EGFRP00533 1210 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 IL1R1P14778 569 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2ADP20671 130 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PTPN7P35236 360 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TIE1P35590 1138 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RGS4P49798 205 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FCGRTP55899 365 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PALB2Q86YC2 1186 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 J3QRK9 145 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ANXA9O76027 345 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO21O94952 628 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TGFB3P10600 412 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NAT1P18440 290 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ARSHQ5FYA8 562 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MTX3Q5HYI7 312 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CDC73Q6P1J9 531 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TRABD2AQ86V40 505 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FBXL8Q96CD0 374 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SPON2Q9BUD6 331 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RGS18Q9NS28 235 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 POLG2Q9UHN1 485 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMX2Q9Y320 296 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ARIH2O95376 493 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SSTR1P30872 391 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms