RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 NRF1Q16656 503 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 IER5Q5VY09 327 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 SLC51BQ86UW2 128 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 RNF149Q8NC42 400 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC15Q96J42 360 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.26■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CLDN25C9JDP6 229 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CTGFP29279 349 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PTP4A2Q12974 167 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TRPC3Q13507 836 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 HIF1AQ16665 826 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 DPP9Q86TI2 863 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 AKAP14Q86UN6 197 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PARVAQ9NVD7 372 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PLLPQ9Y342 182 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GABBR2O75899 941 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TSHRP16473 764 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 IDUAP35475 653 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ARSEP51690 589 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GPS1Q13098 491 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TTLL4Q14679 1199 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB33Q86T24 672 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 OSTM1Q86WC4 334 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 VPS28Q9UK41 221 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.25■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GCNT1Q02742 428 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP1Q07960 439 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 INAVAQ3KP66 663 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CEP78Q5JTW2 689 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TP53INP1Q96A56 240 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 BRCA2P51587 3418 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 EVPLQ92817 2033 aa22.24■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP33O14559 1287 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TMCC2O75069 709 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TSPY1Q01534 308 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 GRB14Q14449 540 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PERM1Q5SV97 790 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ASB14A6NK59 587 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 BANF1O75531 89 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ALDH1A1P00352 501 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 COX4I1P13073 169 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 KRT5P13647 590 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 NR4A2P43354 598 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 C16orf46Q6P387 395 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 MRGBPQ9NV56 204 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.23■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ACOX3O15254 700 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PIAS1O75925 651 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CLCN3P51790 818 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TMBIM6P55061 237 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 PHC1P78364 1004 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FSCBQ5H9T9 825 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM47BQ8NA70 645 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms