RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 RAD54BQ9Y620 910 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ARSAP15289 507 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 DGKZQ13574 1117 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C4orf19Q8IY42 314 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 BAG5Q9UL15 447 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 KIF1AQ12756 1690 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.51■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 E7ESA3 106 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 H0Y626 953 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 TRIM16O95361 564 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CDH13P55290 713 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 KCNJ11Q14654 390 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C12orf29Q8N999 325 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 DPP3Q9NY33 737 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ACOT9Q9Y305 439 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 H0Y858 1186 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SOCS2O14508 198 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SERPINB10P48595 397 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 MAVSQ7Z434 540 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C8orf37Q96NL8 207 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 RNF38Q9H0F5 515 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 EXD2Q9NVH0 621 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SNPHO15079 494 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 PFDN6O15212 129 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 HUS1O60921 280 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CES1P23141 567 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 PRKCQQ04759 706 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 MERTKQ12866 999 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CTBP1Q13363 440 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 POU6F1Q14863 301 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SIAEQ9HAT2 523 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ANKEF1Q9NU02 776 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.5■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 KRBA1A5PL33 1030 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CLDN25C9JDP6 229 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 MICAL2O94851 1124 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 PRKAA2P54646 552 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ACOT1Q86TX2 421 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SFRP1Q8N474 314 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CPB2Q96IY4 423 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 POMKQ9H5K3 350 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SMOXQ9NWM0 555 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 H3BMQ9 156 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 LDLRP01130 860 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 TSHRP16473 764 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 GMCL1Q96IK5 515 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CEP19Q96LK0 163 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 COG8Q96MW5 612 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SUN2Q9UH99 717 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 GABBR2O75899 941 aa16.49■□□□□ 0.23
GPC1-201ENST00000264039 CCNE2O96020 404 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms