RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261439.8

TBC1D1-201, Transcript of TBC1 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBC1D1, Length 5,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D1-201ENST00000261439 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AHSPQ9NZD4 102 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AK5Q9Y6K8 562 aa14.75□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MMP13P45452 471 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARHGAP8P85298 464 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NDUFA5Q16718 116 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PROX1Q92786 737 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ASB7Q9H672 318 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SMIM22K7EJ46 135 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NFICP08651 508 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CRATP43155 626 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ACKR2O00590 384 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LGR5O75473 907 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ATP6AP2O75787 350 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PLCL1Q15111 1095 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GRIK4Q16099 956 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM187BQ17R55 369 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PCID2Q5JVF3 399 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF280DQ6N043 979 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CDC73Q6P1J9 531 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZPBP2Q6X784 338 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LGI2Q8N0V4 545 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LZTR1Q8N653 840 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GIPC3Q8TF64 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PNPOQ9NVS9 261 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RXRGP48443 463 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARCQ7LC44 396 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SFRP1Q8N474 314 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARL15Q9NXU5 204 aa14.74□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ITGAVP06756 1048 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 VCLP18206 1134 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 IL2P60568 153 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PTSQ03393 145 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 VAT1Q99536 393 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CCNA2P20248 432 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CRY1Q16526 586 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PSMD11O00231 422 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 USP4Q13107 963 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 VPS72Q15906 364 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RNF220Q5VTB9 566 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TRABD2AQ86V40 505 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms