RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CCDC157Q569K6 752 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 LINGO4Q6UY18 593 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TTC7BQ86TV6 843 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NAT16Q8N8M0 369 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GSTCDQ8NEC7 633 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CPNE1Q99829 537 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 HGH1Q9BTY7 390 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 UGT1A7Q9HAW7 530 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 UGT1A8Q9HAW9 530 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SNX15Q9NRS6 342 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TMEM51Q9NW97 253 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CROTQ9UKG9 612 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MAGEB16A2A368 324 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MGAT4DA6NG13 374 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IQCF5A8MTL0 148 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 E7ENQ6 273 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 H7C4K7 107 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 RGS5O15539 181 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D4O60343 1298 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PAGE1O75459 146 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FSBPO95073 299 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 LCA5LO95447 670 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MT-ND1P03886 318 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 HSMCR30P0CW71 290 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ME2P23368 584 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IL1R2P27930 398 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GRM5P41594 1212 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CHRNA4P43681 627 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PEX5P50542 639 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FBXW4P57775 412 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 LILRA4P59901 499 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 OLIG2Q13516 323 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NOMO1Q15155 1222 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NEDD8Q15843 81 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CCL14Q16627 93 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SPANXN3Q5MJ09 141 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CNSTQ6PJW8 725 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PACS1Q6VY07 963 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CCDC126Q96EE4 140 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DPY30Q9C005 99 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IL22Q9GZX6 179 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IGFLR1Q9H665 355 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ASB8Q9H765 288 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TSPAN1O60635 241 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TMEM63AO94886 807 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LRIG2O94898 1065 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TBX18O95935 607 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 GSTM1P09488 218 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SMPD1P17405 629 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NCALDP61601 193 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF460Q14592 562 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CRYMQ14894 314 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TRIM60Q495X7 471 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 UTS2BQ765I0 119 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PARP8Q8N3A8 854 aa5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.59□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms