RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258014.3

PKIB-201, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PKIB, Length 1,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-201ENST00000258014 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CLTCL1P53675 1640 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 KIF27Q86VH2 1401 aa3.4□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa3.4□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.39□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 NBNO60934 754 aa3.39□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 LDHCP07864 332 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SLC37A1P57057 533 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 GBX1Q14549 363 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 BRD3Q15059 726 aa3.39□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 KDM1BQ8NB78 822 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PPM1EQ8WY54 764 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SNX21Q969T3 373 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 RUNDC1Q96C34 613 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 APIPQ96GX9 242 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 IL25Q9H293 177 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 MYOM1P52179 1685 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CUL7Q14999 1698 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CGNL1Q0VF96 1302 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 RAD50Q92878 1312 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.39□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CXorf65A6NEN9 183 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 ITGB8P26012 769 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SLC5A2P31639 672 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 HALP42357 657 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 AMTP48728 403 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 ERVK11-1P61568 191 aa3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 STPG1Q5TH74 334 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SWAP70Q9UH65 585 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 CTNNA3Q9UI47 895 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 KIF16BQ96L93 1317 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SHPRHQ149N8 1683 aa3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 PMM2O15305 246 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 MYF5P13349 255 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.38□□□□□ -1.87
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PKIB-201ENST00000258014 FAXCQ5TGI0 409 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 KRT222Q8N1A0 295 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 UHRF2Q96PU4 802 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.38□□□□□ -1.87
PKIB-201ENST00000258014 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.38□□□□□ -1.87
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