RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.72■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CFAP54Q96N23 3096 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 C10orf142B7Z368 130 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ALOX15BO15296 676 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K13O43283 966 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF11O60813 436 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 KDELR1P24390 212 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 OXTRP30559 389 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ACSL1P33121 698 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A1P43005 524 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 VAV2P52735 878 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 GSDMDP57764 484 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 KRT81Q14533 505 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 CYTH1Q15438 398 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ELF2Q15723 593 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 LRRC38Q5VT99 294 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 LZTR1Q8N653 840 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 SCML1Q9UN30 329 aa22.71■■□□□ 1.23
SYF2-201ENST00000236273 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 BUB1O43683 1085 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 BNIP3LO60238 219 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA3P32297 505 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DRD3P35462 400 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PSMD8P48556 350 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PDK2Q15119 407 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CARD16Q5EG05 197 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 USP30Q70CQ3 517 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 FAM124AQ86V42 546 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PLPP6Q8IY26 295 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PQLC3Q8N755 202 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 KCTD6Q8NC69 237 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF670Q9BS34 389 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DESI2Q9BSY9 194 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.7■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LAMA1P25391 3075 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PP55 124 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TMCC1O94876 653 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 IL1BP01584 269 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 C5AR1P21730 350 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TMIEQ8NEW7 156 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GPR174Q9BXC1 333 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 NCDNQ9UBB6 729 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.69■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PLK4O00444 970 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PEX11BO96011 259 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ADH1BP00325 375 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CALN1Q9BXU9 219 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.68■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 DFFAO00273 331 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF33AQ06730 810 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 SPEM2Q0P670 501 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CCDC6Q16204 474 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ARSIQ5FYB1 569 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC3Q96B67 414 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 LHX3Q9UBR4 397 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 METTL12A8MUP2 240 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms