RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 PRR23AA6NEV1 266 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GCATO75600 419 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FGRP09769 529 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CSH1P0DML2 217 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CSH2P0DML3 217 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ALDH9A1P49189 494 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SULT2A1Q06520 285 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RGS1Q08116 209 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF844Q08AG5 666 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ITGADQ13349 1161 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HYIQ5T013 277 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OR8H2Q8N162 312 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 METTL6Q8TCB7 284 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SUSD6Q92537 303 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CAPN15O75808 1086 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MIPP30301 263 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PPM1AP35813 382 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NME5P56597 212 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BMPR2Q13873 1038 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HECTD3Q5T447 861 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EMC1Q8N766 993 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 INVSQ9Y283 1065 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OR6C75A6NL08 312 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TPP1O14773 563 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GLI1P08151 1106 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP4AP20648 1035 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 AMPD1P23109 780 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PSMB9P28065 219 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POU1F1P28069 291 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PSMD5Q16401 504 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CD101Q93033 1021 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CLN6Q9NWW5 311 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM86B1E9PN63 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 UBOX5O94941 541 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OR6A2O95222 327 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HIST1H2ABP04908 130 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM86B2P0C5J1 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FMO4P31512 558 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CHKAP35790 457 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TAF13Q15543 124 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SCAIQ8N9R8 606 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MSRAQ9UJ68 235 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LIASO43766 372 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POMCP01189 267 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MYBL2P10244 700 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RARAP10276 462 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CCDC130P13994 396 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 COPZ1P61923 177 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CXCL9Q07325 125 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A5Q14940 896 aa7.3□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.3□□□□□ -1.24
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