RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem80Q9D3H0 123 aa5.94□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 ErmapQ9JLN5 566 aa5.94□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 B4galt5Q9JMK0 388 aa5.94□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm7942L7N277 499 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 CiitaP79621 1155 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cct7P80313 544 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 RasefQ5RI75 627 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc63Q8CDV6 558 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spp2Q8K1I3 203 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adgrg1Q8K209 687 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kif19Q99PT9 997 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr703Q9EPF5 319 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cntnap4Q99P47 1310 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptpn3A2ALK8 913 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rap1gds1E9Q912 607 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r111K7N674 857 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Schip1P0DPB4 484 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 PrkczQ02956 592 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 BegainQ68EF6 600 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Neu4Q8BZL1 478 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Snx16Q8C080 344 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc142Q8CAI1 738 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam187aQ9D3R5 417 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Galk1Q9R0N0 392 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dpysl4O35098 572 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spink5Q148R4 1017 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 McuQ3UMR5 350 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc18a2Q8BRU6 517 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Stk11Q9WTK7 436 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 PrebQ9WUQ2 417 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prpmp5E9PXN1 296 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prl6a1O35257 230 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc1a6O35544 561 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Alkbh5Q3TSG4 395 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dupd1Q8BK84 215 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zw10O54692 779 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 MarcoQ60754 518 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf512Q69Z99 562 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpatch2lQ6PE65 482 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Samd14Q8K070 417 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 TraipQ8VIG6 470 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf622Q91VY9 476 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adcy4Q91WF3 1077 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q91Z58 1206 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dpy30Q99LT0 99 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dmap1Q9JI44 468 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm13941A2AJ38 245 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ralgps1A2AR50 585 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ifi213D3Z5G0 586 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mc4rP56450 332 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pkn2Q8BWW9 983 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Arhgap25Q8BYW1 648 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Taf10Q8K0H5 218 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dhx34Q9DBV3 1145 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mpp5Q9JLB2 675 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Chrna6Q9R0W9 494 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm13119B1ARV5 481 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pdzd8B9EJ80 1147 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mmp15O54732 657 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kcnu1O54982 1121 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ankmy2Q3TPE9 440 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 CgasQ8C6L5 507 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Anks3Q9CZK6 655 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Acp4D3YTS9 425 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pitpnm1O35954 1243 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klc1O88447 541 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Traf2P39429 501 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 FaxcQ3UMF9 409 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ssxb5Q6XAS2 159 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adam39Q7M762 756 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kat5Q8CHK4 513 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gdap2Q9DBL2 498 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Abca3Q8R420 1704 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Col5a2Q3U962 1497 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm13088A2AGW6 460 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr742A2RTP5 311 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sppl2bQ3TD49 578 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ulk3Q3U3Q1 472 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 ToporsQ80Z37 1033 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec4gQ8BNX1 294 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clptm1Q8VBZ3 664 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tex12Q9CR81 123 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pole3Q9JKP7 145 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 CpqQ9WVJ3 470 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Smok3aC0HKC8 504 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Smok3bC0HKC9 504 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tekt5G5E8A8 557 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccr5P51682 354 aa5.93□□□□□ -1.46
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gabrr2P56476 465 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms