RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgef33Q8BW86 850 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp45Q8K387 813 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sntg2Q925E0 539 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MtapQ9CQ65 283 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Med4Q9CQA5 270 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Alg14Q9D081 217 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam166aQ9D4K5 319 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc89Q9DA73 370 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fthl17aQ9DAX0 182 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Jph3Q9ET77 744 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cacng3Q9JJV5 315 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Capn15Q9JLG8 1095 aa7.9□□□□□ -1.14
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plce1Q8K4S1 2282 aa7.9□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgef10Q8C033 1345 aa7.9□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MgamB5THE2 1827 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lcn6A2AJB9 181 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Etnk2A7MCT6 385 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nhsl2B1AXH1 854 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AU015836B2RUM3 263 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm5934D3Z4U6 212 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PspnO70300 156 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AfpP02772 605 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abcd1P48410 736 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 IduaP48441 634 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HccsP53702 272 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dsc1P55849 886 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrps6P58064 125 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Foxp2P58463 714 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc3P59034 257 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgap39P59281 1107 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MybphP70402 483 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Serpina5P70458 405 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ptchd1Q14B62 888 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Faap20Q3UN58 186 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kdm7aQ3UWM4 940 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Armcx5Q3UZB0 606 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sema3gQ4LFA9 780 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 N4bp1Q6A037 893 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc39a4Q78IQ7 660 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Oog2Q7TPX8 476 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 LnpkQ7TQ95 425 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wdtc1Q80ZK9 677 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm5622Q810Q0 167 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zscan22Q8BGS5 496 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Edem2Q8BJT9 577 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 LarsQ8BMJ2 1178 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tns4Q8BZ33 696 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam114a2Q8VE88 497 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aipl1Q924K1 328 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Thap2Q9D305 217 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fbxl12Q9EPX5 326 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Akip1Q9JJR5 212 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ChmlQ9QZD5 621 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rnf103Q9R1W3 683 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc26a3Q9WVC8 757 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gadd45gQ9Z111 159 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mtm1Q9Z2C5 603 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CitP49025 2055 aa7.89□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AcacbE9Q4Z2 2448 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm13283A0A087WPG5 182 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ajm1A2AJA9 974 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ajap1A2ALI5 412 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mctp1E9PV86 951 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr552E9Q545 317 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp949E9Q732 603 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm597E9Q8J5 896 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Colca2F8VPY8 239 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Grip2G3XA20 1042 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm3542K7N6U2 270 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm2888K7N746 267 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tnfrsf18O35714 228 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Impa1O55023 277 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ImpactO55091 318 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Coro1aO89053 461 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sp1O89090 784 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt13P08730 437 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hoxa9P09631 271 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sod2P09671 222 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gabrg2P22723 474 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cd247P24161 164 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Klrb1cP27814 223 aa7.88□□□□□ -1.15
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TshrP47750 764 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms