RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pin4Q9CWW6 131 aa8.61□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1023A2ASU6 311 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ItgavP43406 1044 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nrp1P97333 923 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klra4Q60651 263 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Letm2Q7TNU7 480 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hdac7Q8C2B3 938 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1352Q8VGX5 309 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adgrf4Q9D2L6 698 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem80Q9D3H0 123 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cpxm1Q9Z100 722 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Megf6Q80V70 1572 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfr2E9Q5M4 874 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8909G3UXE9 396 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc16a1P53986 493 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfm3P63056 478 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ArvcfP98203 962 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CkbQ04447 381 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Serac1Q3U213 654 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nat9Q3UG98 241 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MelkQ61846 643 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr20Q7TRX9 314 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slco2b1Q8BXB6 683 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cep57Q8CEE0 500 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr695Q8VFM3 315 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hdac11Q91WA3 347 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sytl2Q99N50 950 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rgs3Q9DC04 966 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 IkbkeQ9R0T8 717 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trbv4A0A075B5I2 113 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PiggD3Z3Y1 983 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3526E9PZM0 191 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm4450E9Q007 373 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srp72F8VQC1 671 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ctbp1O88712 441 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ptpn1P35821 432 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hsd3b4Q61767 373 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gdpd5Q640M6 607 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam107aQ78TU8 144 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fzd10Q8BKG4 582 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snx30Q8CE50 437 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8VDP2 222 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 March2Q99M02 246 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PompQ9CQT5 141 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Irx5Q9JKQ4 484 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scgb2b21A0A087WQA9 112 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hes2O54792 157 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lamp2P17047 415 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pou4f1P17208 421 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndst2P52850 883 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il1rapl1P59823 695 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dlg3P70175 849 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1105Q7TR58 312 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gramd1bQ80TI0 738 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arhgap11aQ80Y19 987 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc44a2Q8BY89 706 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TwnkQ8CIW5 685 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acsl5Q8JZR0 683 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clptm1Q8VBZ3 664 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sult5a1Q91X36 291 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnft1Q9DCN7 395 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zbtb18Q9WUK6 522 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clec4fP70194 548 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DsppP97399 934 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gata5P97489 404 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ubxn7Q6P5G6 467 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Med21Q9CQ39 144 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zbtb12Q9Z150 459 aa8.6□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NrapQ80XB4 1728 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kctd18E0CZ26 429 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm379J3QQ19 296 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt1P04104 637 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rfx2P48379 717 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdp2Q504M2 532 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q5XFZ0 217 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cand2Q6ZQ73 1235 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nod1Q8BHB0 953 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8BP99 230 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Samd3Q8C4H2 520 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SarafQ8R3Q0 334 aa8.59□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.3 ms