RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		20.9	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	ATP2A3	Q93084	1043 aa		20.9	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	AGAP2	Q99490	1192 aa		20.9	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	MECR	Q9BV79	373 aa		20.9	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	KLF11	O14901	512 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	IGLV3-27	P01718	113 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	TLE2	Q04725	743 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	RING1	Q06587	406 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	SETDB1	Q15047	1291 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	IGSF8	Q969P0	613 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	HMCES	Q96FZ2	354 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	FICD	Q9BVA6	458 aa		20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.94
ME2-216	ENST00000639850	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	NMBR	P28336	390 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	OR1D2	P34982	312 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	BNIP1	Q12981	228 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	RBBP8	Q99708	897 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	KIFC1	Q9BW19	673 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	MTRR	Q9UBK8	725 aa		20.89	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PMPCB	O75439	489 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DCTN3	O75935	186 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TYK2	P29597	1187 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	RENBP	P51606	427 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	IKBKE	Q14164	716 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TRIM60	Q495X7	471 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ZNF398	Q8TD17	642 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	GLRA3	O75311	464 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PCID2	Q5JVF3	399 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ATG16L1	Q676U5	607 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	E2F7	Q96AV8	911 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ECT2	Q9H8V3	914 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	CHKB	Q9Y259	395 aa		20.88	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	CCDC78	A2IDD5	438 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850		J3KR12	359 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	C2CD2L	O14523	706 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PEX11B	O96011	259 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TMPRSS15	P98073	1019 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ZNF778	Q96MU6	729 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	CWH43	Q9H720	699 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	SP110	Q9HB58	689 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	MYLK	Q15746	1914 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DRGX	A6NNA5	263 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	BIRC5	O15392	142 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	EFEMP2	O95967	443 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	IL1B	P01584	269 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ADRA1A	P35348	466 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	LIMK2	P53671	638 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	POU6F1	Q14863	301 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	CHI3L2	Q15782	390 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	DCLK2	Q8N568	766 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	IGSF21	Q96ID5	467 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TOX2	Q96NM4	488 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		20.87	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	TGDS	O95455	350 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	BPGM	P07738	259 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	IRX4	P78413	519 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	MARC1	Q5VT66	337 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	PACS2	Q86VP3	889 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	FATE1	Q969F0	183 aa		20.86	■□□□□ 0.93
ME2-216	ENST00000639850	AZIN2	Q96A70	460 aa		20.86	■□□□□ 0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms