RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CAPN10Q9HC96 672 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PADI3Q9ULW8 664 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ATP6AP2O75787 350 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SP2Q02086 613 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 IKBKEQ14164 716 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DPY30Q9C005 99 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 POLG2Q9UHN1 485 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 AGPSO00116 658 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RAD51BO15315 384 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ENTPD5O75356 428 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PCNAP12004 261 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ME2P23368 584 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ABL2P42684 1182 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MICU2Q8IYU8 434 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MED8Q96G25 268 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 USP1O94782 785 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 GPC1P35052 558 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 WNT3AP56704 352 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SPOCK2Q92563 424 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 APPL1Q9UKG1 709 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MDM4O15151 490 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PAGE1O75459 146 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 GRIK3Q13003 919 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PSMD5Q16401 504 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 STK32AQ8WU08 396 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TMEM159Q96B96 161 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 C12orf42Q96LP6 360 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 HGH1Q9BTY7 390 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MFSD11O43934 449 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PCDH8O95206 1070 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 IGSF6O95976 241 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 GRIA4P48058 902 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 LILRA4P59901 499 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 IL2P60568 153 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 FKBP1BP68106 108 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DUSP4Q13115 394 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ITGA7Q13683 1181 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PACS1Q6VY07 963 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 GPSM1Q86YR5 675 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 AGAP11Q8TF27 550 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 HDAC10Q969S8 669 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SNX15Q9NRS6 342 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PDP2Q9P2J9 529 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 XPR1Q9UBH6 696 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SEC22BO75396 215 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 VNN1O95497 513 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 OR1D2P34982 312 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RFX3P48380 749 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RABGGTBP53611 331 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PRKAA2P54646 552 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CRYMQ14894 314 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PTPRNQ16849 979 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RMND5AQ9H871 391 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SUFUQ9UMX1 484 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 LMO2P25791 158 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms