RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.62■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 BPTFQ12830 3046 aa22.62■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 CBX4O00257 560 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 SLC7A4O43246 635 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 LATO43561 262 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 IL1BP01584 269 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 CD38P28907 300 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 FLT3P36888 993 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 NUMBP49757 651 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 CLDN6P56747 220 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 ARTNQ5T4W7 220 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TAF3Q5VWG9 929 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ERICH1Q86X53 443 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TBCBQ99426 244 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 WDCPQ9H6R7 721 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.61■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 CNTN5O94779 1100 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 WNT1P04628 370 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G2AP14555 144 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 METAP1P53582 386 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ILKQ13418 452 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ALFQ53S48 1182 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TRNP1Q6NT89 227 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ZNF677Q86XU0 584 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 EID2Q8N6I1 236 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 C1orf74Q96LT6 269 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 PSMB7Q99436 277 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 SIK2Q9H0K1 926 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 DRGXA6NNA5 263 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 MCF2LO15068 1137 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 MMEP08473 750 aa22.59■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 PPP2CBP62714 309 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 PPP2CAP67775 309 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 DEUP1Q05D60 604 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 DLG2Q15700 870 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 Q6ZVU0 165 aa22.59■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.59■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.59■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PR77 199 aa22.58■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 JAM2P57087 298 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 KRT31Q15323 416 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 C2CD6Q53TS8 623 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 AGBL4Q5VU57 503 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 GPR155Q7Z3F1 870 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 ZNF605Q86T29 641 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SRRT-218ENST00000620394 MUC3BQ9H195 1237 aa22.58■■□□□ 1.21
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SRRT-218ENST00000620394 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 NAA35Q5VZE5 725 aa22.57■■□□□ 1.2
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SRRT-218ENST00000620394 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 ZNF843Q8N446 348 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 FGF11Q92914 225 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 HAPLN3Q96S86 360 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.57■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.57■■□□□ 1.2
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SRRT-218ENST00000620394 ENDOD1O94919 500 aa22.56■■□□□ 1.2
SRRT-218ENST00000620394 ACTN2P35609 894 aa22.56■■□□□ 1.2
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SRRT-218ENST00000620394 CLCN6P51797 869 aa22.56■■□□□ 1.2
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SRRT-218ENST00000620394 KRT83P78385 493 aa22.56■■□□□ 1.2
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