RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CIPCQ9C0C6 399 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SUN2Q9UH99 717 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 H3BRJ5 948 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRIM24O15164 1050 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PJA2O43164 708 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DAPK3O43293 454 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CREB3O43889 395 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRIG2O94898 1065 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RHOCP08134 193 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EPHB2P29323 1055 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HOXC13P31276 330 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CD70P32970 193 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNR2P34972 360 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARL4AP40617 200 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VAV2P52735 878 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TPI1P60174 286 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ECT2LQ008S8 904 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC20A2Q08357 652 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIF5AQ12840 1032 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SEMA3BQ13214 749 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ENPP2Q13822 863 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GAS6Q14393 721 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MESDQ14696 234 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STARD3Q14849 445 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDK2Q15119 407 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DPYSL2Q16555 572 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAB6CQ53S08 254 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FSCBQ5H9T9 825 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRRC38Q5VT99 294 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 Q6ZS52 159 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIAA1328Q86T90 577 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LZTR1Q8N653 840 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 P2RY11Q96G91 374 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BTBD6Q96KE9 485 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GABRG3Q99928 467 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRIM7Q9C029 511 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MUC3BQ9H195 1237 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAGEH1Q9H213 219 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FBRSQ9HAH7 460 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CAPN10Q9HC96 672 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNTN5O94779 1100 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 APBB3O95704 486 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RARAP10276 462 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSKP41240 450 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NDST2P52849 883 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GNA12Q03113 381 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MESP2Q0VG99 397 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF234Q14588 700 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CRY1Q16526 586 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ALFQ53S48 1182 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ODF2Q5BJF6 829 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EMC10Q5UCC4 262 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM215Q68D42 235 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms