RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 HPDLQ96IR7 371 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 NLRP4Q96MN2 994 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 VPS11Q9H270 941 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CAPN10Q9HC96 672 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KLC4Q9NSK0 619 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 EURLQ9NYK6 297 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SEPT3Q9UH03 358 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MED13Q9UHV7 2174 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 E7ENQ6 273 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TP73O15350 636 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DIAPH2O60879 1101 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 RASSF9O75901 435 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SOD2P04179 222 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KRT19P08727 400 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ITGB6P18564 788 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 KDELR1P24390 212 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MARK3P27448 753 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SDC4P31431 198 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PTPN9P43378 593 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SCTRP47872 440 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 RAD23BP54727 409 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R40P59535 323 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PON2Q15165 354 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KYNUQ16719 465 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 LONRF1Q17RB8 773 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 CCDC142Q17RM4 750 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 AADACL2Q6P093 401 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DPH6Q7L8W6 267 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MCUQ8NE86 351 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-218ENST00000584243 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MKS1Q9NXB0 559 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 RRN3Q9NYV6 651 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 GINS2Q9Y248 185 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-218ENST00000584243 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 M0QYV0 167 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 M0QZ92 97 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 APOL1O14791 398 aa8.27□□□□□ -1.09
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GGA3-218ENST00000584243 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MLNP12872 115 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CEBPBP17676 345 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CTHP32929 405 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MSH2P43246 934 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GPD2P43304 727 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SERPINB9P50453 376 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MNAT1P51948 309 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BCAT1P54687 386 aa8.27□□□□□ -1.09
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