RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SPEGQ15772 3267 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PLXNA2O75051 1894 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM131Q92545 1883 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ILVBLA1L0T0 632 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 K7ERQ8 282 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ATP9BO43861 1147 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MT-CO1P00395 513 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SKILP12757 684 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SRCP12931 536 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GOT1P17174 413 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DNA2P51530 1060 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GALCP54803 685 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC4P56524 1084 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GNA12Q03113 381 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EFHC2Q5JST6 749 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RETSATQ6NUM9 610 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZVU0 165 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 BNIPLQ7Z465 357 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC185Q8N715 623 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB124Q8NES8 71 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FRS2Q8WU20 508 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB7Q99436 277 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DYRK4Q9NR20 520 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PARVAQ9NVD7 372 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DNAI1Q9UI46 699 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 VPS51Q9UID3 782 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GVT2 93 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FAM72CH0Y354 149 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GIPC1O14908 333 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MCF2LO15068 1137 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCP110O43303 1012 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CREB3O43889 395 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RNF8O76064 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 LRIG2O94898 1065 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TPM3P06753 285 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ADRB1P08588 477 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM1P13688 526 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RHOQP17081 205 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GLDCP23378 1020 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PSMA2P25787 234 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CD27P26842 260 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EPHB2P29323 1055 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNA3P32297 505 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ETFBP38117 255 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 C21orf59P57076 290 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC20A2Q08357 652 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GRIK2Q13002 908 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TMC6Q7Z403 805 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FAM72BQ86X60 149 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AADATQ8N5Z0 425 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SKA1Q96BD8 255 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CNPY3Q9BT09 278 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GAREM1Q9H706 876 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IFNKQ9P0W0 207 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms