RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566929.1

AC008938.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC008938.1, Length 6,510 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008938.1-201ENST00000566929 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 TRIM13O60858 407 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 PAGE1O75459 146 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 NFKB1P19838 968 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 NPNTQ6UXI9 565 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 CREG2Q8IUH2 290 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ZNF384Q8TF68 577 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 TADA1Q96BN2 335 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 RAB21Q9UL25 225 aa9.53□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 BMP6P22004 513 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 RRM2P31350 389 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 CLCNKBP51801 687 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 DUSP4Q13115 394 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 NFYCQ13952 458 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 RDH11Q8TC12 318 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 ACOX2Q99424 681 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 GMLQ99445 158 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 CHST7Q9NS84 486 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 KLC4Q9NSK0 619 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 MPP6Q9NZW5 540 aa9.52□□□□□ -0.88
AC008938.1-201ENST00000566929 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 WNT7AO00755 349 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ZBTB22O15209 634 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CCL5P13501 91 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 RHOQP17081 205 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 GOT1P17174 413 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CALB2P22676 271 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 HTR1BP28222 390 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 IRAK1P51617 712 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 RAB30Q15771 203 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CRY1Q16526 586 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 RNF19AQ9NV58 838 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 GMIPQ9P107 970 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 SNTNA6NMZ2 147 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CCL16O15467 120 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 PTPN9P43378 593 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 POLD2P49005 469 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 MAPKAPK2P49137 400 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CDH4P55283 916 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 JAM2P57087 298 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CDC16Q13042 620 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 NEPROQ6NW34 567 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 C12orf29Q8N999 325 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 SEMA4DQ92854 862 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 OPTCQ9UBM4 332 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 UBDO15205 165 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 DNTTP04053 509 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 BGNP21810 368 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 KELP23276 732 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CCND1P24385 295 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 SLC5A3P53794 718 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ZBTB17Q13105 803 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 DOK6Q6PKX4 331 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 MYO19Q96H55 970 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 HEY2Q9UBP5 337 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 BTN3A1O00481 513 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ANXA5P08758 320 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 FCGR1AP12314 374 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 TAF10Q12962 218 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 BMPR2Q13873 1038 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 FLOT2Q14254 428 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.52□□□□□ -0.89
AC008938.1-201ENST00000566929 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms