RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ACP1	P24666	158 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CD70	P32970	193 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GABRB2	P47870	512 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PSEN1	P49768	467 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DAOA	P59103	153 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MBLAC2	Q68D91	279 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CNGA4	Q8IV77	575 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TC2N	Q8N9U0	490 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MYO19	Q96H55	970 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SATB2	Q9UPW6	733 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222		E7ENQ6	273 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	14.22	□□□□□ -0.13	1e-14	■■□□□ 12.5
CS-231	ENST00000552222	OPA1	O60313	960 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ERBB2	P04626	1255 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CDK4	P11802	303 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TNFAIP3	P21580	790 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MMP8	P22894	467 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SNX16	P57768	344 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CENPC	Q03188	943 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNF276	Q8N554	614 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MIS12	Q9H081	205 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	C10orf142	B7Z368	130 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CHKA	P35790	457 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	UCN	P55089	124 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DAB2	P98082	770 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PTP4A2	Q12974	167 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ILK	Q13418	452 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GSE1	Q14687	1217 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	EXTL1	Q92935	676 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	C18orf8	Q96DM3	657 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MYOC	Q99972	504 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SYNC	Q9H7C4	482 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GGA2	Q9UJY4	613 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	RELN	P78509	3460 aa		14.21	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM170A	A1A519	330 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TTC34	A8MYJ7	566 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LTF	P02788	710 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CYBB	P04839	570 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM87A	P0C7U9	286 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GIMD1	P0DJR0	217 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C7	P10643	843 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GZMA	P12544	262 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ITGB6	P18564	788 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RXRG	P48443	463 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	LSS	P48449	732 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PSMD8	P48556	350 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CDK17	Q00537	523 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CLN3	Q13286	438 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CST6	Q15828	149 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		14.2	□□□□□ -0.14

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