RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549815.1

GCN1-206, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-206	ENST00000549815	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TAF4	O00268	1085 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TNFSF14	O43557	240 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RRM1	P23921	792 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CHRNA3	P32297	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CLCN6	P51797	869 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TLR4	O00206	839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	BNIP3L	O60238	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GJB6	O95452	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CD160	O95971	181 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OR1E1	P30953	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NUDT1	P36639	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	STAT1	P42224	750 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RXRG	P48443	463 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARF5	P84085	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ATP11A	P98196	1134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SCAP	Q12770	1279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NCAPH	Q15003	741 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SYCP1	Q15431	976 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ADRA1B	P35368	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PTPN9	P43378	593 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	HDAC4	P56524	1084 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GNA12	Q03113	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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