RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB106AQ8N104 65 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 INPP5DQ92835 1189 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CA12O43570 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCNB1P14635 433 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MGAT1P26572 445 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPR1P46091 355 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CRYMQ14894 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LAYNQ6UX15 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KAT2BQ92831 832 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CD101Q93033 1021 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYLDQ9NQC7 956 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POLE3Q9NRF9 147 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CENPXA8MT69 81 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TBL1XO60907 577 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD10O75832 226 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ENDOD1O94919 500 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IGFBP4P22692 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GLRBP48167 497 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IRAK1P51617 712 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PSMC6P62333 389 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MICU2Q8IYU8 434 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CORO1BQ9BR76 489 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KRT75O95678 551 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF682O95780 498 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STX4Q12846 297 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CEP78Q5JTW2 689 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA20Q8TB22 786 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RDH11Q8TC12 318 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD7Q92527 254 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MTMR9Q96QG7 549 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ARL15Q9NXU5 204 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 AVILO75366 819 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OR6A2O95222 327 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MON1AQ86VX9 555 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PALMDQ9NP74 551 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WDR27A2RRH5 827 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 E5RJQ4 531 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GRM6O15303 877 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RIPK2O43353 540 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM13O60858 407 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SEC22BO75396 215 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC25A12O75746 678 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CXCL14O95715 111 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 APODP05090 189 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 COX7A2P14406 83 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYP3A5P20815 502 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 AMPD1P23109 780 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GRM5P41594 1212 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFV1P49821 464 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NEK3P51956 506 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 COPZ1P61923 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RCN1Q15293 331 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EMC1Q8N766 993 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 METTL6Q8TCB7 284 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VMP1Q96GC9 406 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CROTQ9UKG9 612 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.48□□□□□ -1.37
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