RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	NME3	Q13232	169 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	NPAS2	Q99743	824 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
DDX11-223	ENST00000542838	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CABYR	O75952	493 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TPH1	P17752	444 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	AVPR1A	P37288	418 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	HERC3	Q15034	1050 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ANO4	Q32M45	955 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838		M0QYT0	321 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SBK3	P0C264	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CLCN2	P51788	898 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	APOF	Q13790	326 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DCLK1	O15075	740 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TADA2A	O75478	443 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	VAPB	O95292	243 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PSMC3	P17980	439 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PRKAA2	P54646	552 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NR1H2	P55055	460 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DPYS	Q14117	519 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ACOT8	O14734	319 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DAB1	O75553	588 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	DDHD2	O94830	711 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LGALS2	P05162	132 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ERCC2	P18074	760 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NMBR	P28336	390 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	EME1	Q96AY2	570 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	TRIM38	O00635	465 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CYP2B6	P20813	491 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NPY2R	P49146	381 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	HPCA	P84074	193 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CYTH1	Q15438	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	NRF1	Q16656	503 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	GPR22	Q99680	433 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	APBA2	Q99767	749 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX11-223	ENST00000542838	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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