RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CASS4Q9NQ75 786 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 GBF1Q92538 1859 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 HMX2A2RU54 273 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 DFFAO00273 331 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 CCNCP24863 283 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 BNIP1Q12981 228 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SETDB1Q15047 1291 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MANEALQ5VSG8 457 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TSGA13Q96PP4 275 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 OBSL1O75147 1896 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TLL1O43897 1013 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CRHR1P34998 444 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR65Q8IYL9 337 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 DPF3Q92784 378 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 AP3B1O00203 1094 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD3O43242 534 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 USP12O75317 370 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF15O94989 841 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31D3P0C874 917 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX4P57082 545 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 OLIG2Q13516 323 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PACS1Q6VY07 963 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 C14orf80Q86SX3 495 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF398Q8TD17 642 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRN2Q92932 1015 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFATQ9P243 1243 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP290O15078 2479 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMA3Q16787 3333 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEB16A2A368 324 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR5O60602 858 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DCTN3O75935 186 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A3P11169 496 aa20.63■□□□□ 0.89
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PACSIN3-211ENST00000539589 ERVFC1P60507 584 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TWF1Q12792 350 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF3Q86WH2 238 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MIB1Q86YT6 1006 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CERS2Q96G23 380 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MYRFLQ96LU7 910 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF9O75901 435 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNB1P14635 433 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBP50607 506 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 C10orf82Q8WW14 230 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf74Q96LT6 269 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ECT2Q9H8V3 914 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP73A6NFT4 308 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF11O14901 512 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL14O95715 111 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV3-27P01718 113 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 BGNP21810 368 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJB1P25685 340 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 BMPR1AP36894 532 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH1A3P47895 512 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CES3Q6UWW8 571 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00523Q86TU6 105 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM135Q86UB9 458 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-211ENST00000539589 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
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