RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GAD2Q05329 585 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNGA3Q16281 694 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NPNTQ6UXI9 565 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNK18Q7Z418 384 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2E3Q969T4 207 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 THTPAQ9BU02 230 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RERGLQ9H628 205 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IMPAD1Q9NX62 359 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MPP6Q9NZW5 540 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INSL6Q9Y581 213 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0B4J269 797 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NFKBIEO00221 500 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN1O60635 241 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KRT34O76011 436 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PARP6Q2NL67 630 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PLD3Q8IV08 490 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 P3H2Q8IVL5 708 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf29Q8N999 325 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EME1Q96AY2 570 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POMKQ9H5K3 350 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 E9PBE3 544 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FZD9O00144 591 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RGS14O43566 566 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CPA3P15088 417 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IL2P60568 153 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SYT12Q8IV01 421 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GPR135Q8IZ08 494 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ADI1Q9BV57 179 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CLUHO75153 1309 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C8AP07357 584 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NFKB1P19838 968 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PSMB4P28070 264 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4F8P98187 520 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CAP1Q01518 475 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 XKR4Q5GH76 650 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 USP6NLQ92738 828 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HGH1Q9BTY7 390 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HPSEQ9Y251 543 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BAIAP3O94812 1187 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ITGB5P18084 799 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POU1F1P28069 291 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DGKEP52429 567 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC142Q17RM4 750 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 AAK1Q2M2I8 961 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 WDR59Q6PJI9 974 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PIF1Q9H611 641 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RFC2P35250 354 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POLE2P56282 527 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms