RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534499.1

RAB30-AS1-208, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RAB30-AS1, Length 597 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ARL5CA6NH57 179 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 J3KRW8 73 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 BTN3A1O00481 513 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ACKR2O00590 384 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TEX33O43247 280 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KLHL18O94889 574 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLITRK3O94933 977 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MATN4O95460 622 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GYPEP15421 78 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CMA1P23946 247 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SERPINF1P36955 418 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KCNJ5P48544 419 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLC13A2Q13183 592 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CALCRLQ16602 461 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HYIQ5T013 277 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PIGOQ8TEQ8 1089 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TCP11Q8WWU5 503 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GORASP1Q9BQQ3 440 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.14□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 A0A1B0GVL5 298 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TEX28O15482 410 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ARHGAP6O43182 974 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IRAK2O43187 625 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RFPL2O75678 378 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ABHD16AO95870 558 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 URODP06132 367 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPATA31D3P0C874 917 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FPR1P21462 350 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GLRA2P23416 452 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ETV4P43268 484 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PTENP60484 403 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SP140Q13342 867 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GIT2Q14161 759 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SHC4Q6S5L8 630 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GPR149Q86SP6 731 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 STK32CQ86UX6 486 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ENGASEQ8NFI3 743 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TMEM175Q9BSA9 504 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ACTL7AQ9Y615 435 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PLXNA3P51805 1871 aa10.13□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 AREL1O15033 823 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NARSO43776 548 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NEMFO60524 1076 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RHOBTB3O94955 611 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PYGLP06737 847 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TNFAIP3P21580 790 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SSTR4P31391 388 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TXKP42681 527 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RARRES1P49788 294 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NDUFA8P51970 172 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ITGA8P53708 1063 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DSC1Q08554 894 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RAB32Q13637 225 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPARCL1Q14515 664 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RESP18Q5W5W9 173 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NOTUMQ6P988 496 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms