RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 NOTUMQ6P988 496 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HTR3DQ70Z44 454 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 METTL13Q8N6R0 699 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ST8SIA2Q92186 375 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TTC17Q96AE7 1141 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 VOPP1Q96AW1 172 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LENG9Q96B70 501 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ARL8AQ96BM9 186 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TBCBQ99426 244 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MNTQ99583 582 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM2Q99965 735 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DPH1Q9BZG8 443 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 WDCPQ9H6R7 721 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TLE6Q9H808 572 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.59□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 B5MCH6 92 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 FAM86B1E9PN63 330 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MBTPS2O43462 519 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 FRS3O43559 492 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC3O43617 180 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NEMFO60524 1076 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MFAP3LO75121 409 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PSMD10O75832 226 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 FGF18O76093 207 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 HOXA9P31269 272 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CD52P31358 61 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3CGP48736 1102 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PRIM2P49643 509 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GPC3P51654 580 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CASP5P51878 434 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CHN2P52757 468 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SOX8P57073 446 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP6Q16828 381 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EMC10Q5UCC4 262 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.685e-7■■□□□ 13.4
HDAC2-216ENST00000523628 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF276Q8N554 614 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TBCKQ8TEA7 893 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 POF1BQ8WVV4 589 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 KIFAP3Q92845 792 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 APIPQ96GX9 242 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 UROC1Q96N76 676 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TLR10Q9BXR5 811 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 JKAMPQ9P055 326 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EYSQ5T1H1 3165 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 WDR81Q562E7 1941 aa4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 BRWD1Q9NSI6 2320 aa4.57□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
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