RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500025.2

CSTF3-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSTF3-AS1, Length 2,031 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9□□□□□ -0.97
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MTRRQ9UBK8 725 aa9□□□□□ -0.97
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