RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 TULP3O75386 442 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NFATC1O95644 943 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT3O95989 172 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 IGLV2-14P01704 120 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ARSAP15289 507 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MVDP53602 400 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ADPRHP54922 357 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TUBA4AP68366 448 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 PROSER3Q2NL68 480 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MDGA2Q7Z553 956 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NCSTNQ92542 709 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 IP6K1Q92551 441 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TM2D2Q9BX73 214 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 VEZTQ9HBM0 779 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CD207Q9UJ71 328 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 PKP3Q9Y446 797 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 LRP5O75197 1615 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC18Q5T9S5 1454 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CEP152O94986 1710 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SPTLC2O15270 562 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 USP12O75317 370 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CBX6O95503 412 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TBX18O95935 607 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CD72P21854 359 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ABCD3P28288 659 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TYK2P29597 1187 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 HNF1BP35680 557 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CDH15P55291 814 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CAMK1Q14012 370 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT3Q14435 633 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 IL13RA2Q14627 380 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SEC23BQ15437 767 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT7Q86SF2 657 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 KLBQ86Z14 1044 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 FAM47BQ8NA70 645 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CHFRQ96EP1 664 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 C5orf34Q96MH7 638 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 AASSQ9UDR5 926 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 DHDHQ9UQ10 334 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NCOA2Q15596 1464 aa4.69□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TNRQ92752 1358 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CXorf65A6NEN9 183 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 B4E171 279 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 HBP1O60381 514 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 PLAUP00749 431 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CD63P08962 238 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 BMP5P22003 454 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 TSPAN7P41732 249 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 GPD2P43304 727 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 BAK1Q16611 211 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 NAA35Q5VZE5 725 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-215ENST00000498054 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms