RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	USP1	O94782	785 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TPPP	O94811	219 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MT-ND3	P03897	115 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SNHG28	P0DPA3	235 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CKMT1A	P12532	417 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	P4HA1	P13674	534 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ALOX12	P18054	663 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	YY1	P25490	414 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DUSP1	P28562	367 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HNF4A	P41235	474 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TUB	P50607	506 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CDK7	P50613	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	JAK3	P52333	1124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FOXL2	P58012	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	AP1B1	Q10567	949 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HYAL1	Q12794	435 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SEMA3B	Q13214	749 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SLC14A1	Q13336	389 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CUL4A	Q13619	759 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TNIP1	Q15025	636 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RASA2	Q15283	850 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DENND2C	Q68D51	928 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	AWAT2	Q6E213	333 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TRABD2A	Q86V40	505 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	EXD3	Q8N9H8	876 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	GLMP	Q8WWB7	406 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	P2RY11	Q96G91	374 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FSD1	Q9BTV5	496 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MECR	Q9BV79	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HPF1	Q9NWY4	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF711	Q9Y462	761 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ABCC9	O60706	1549 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC69	A6NI79	296 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM25E	A8MYX2	175 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FCHO1	O14526	889 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RRH	O14718	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DOK2	O60496	412 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KAT7	O95251	611 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	GUCA1C	O95843	209 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CYP21A2	P08686	494 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CLTB	P09497	229 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	IGFBP2	P18065	325 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MMP8	P22894	467 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ATP5D	P30049	168 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	IDUA	P35475	653 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HADHA	P40939	763 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CD86	P42081	329 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	GSTM5	P46439	218 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TRPC1	P48995	793 aa		2.72	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms