RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NOTCH4Q99466 2003 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 H0Y626 953 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 CACNG3O60359 315 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 ETFBP38117 255 aa27.33■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 MAGEA3P43357 314 aa27.33■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.33■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 CDH18Q13634 790 aa27.3■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa27.3■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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HOXB3-210ENST00000489475 TPGS1Q6ZTW0 290 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA22Q8NHS9 363 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A51Q9H1U9 297 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXB3-210ENST00000489475 HAUS2Q9NVX0 235 aa27.29■■□□□ 1.96
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