RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486975.1

CLDN11-207, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN11, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-207ENST00000486975 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FAM170AA1A519 330 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 VILLO15195 856 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 LATO43561 262 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SH3BP5O60239 455 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 CBFA2T3O75081 653 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TRIM16O95361 564 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 KRT3P12035 628 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FERP16591 822 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OR1E1P30953 314 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ADRA1BP35368 520 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ATP11AP98196 1134 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 KIF19Q2TAC6 998 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ACCSLQ4AC99 568 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 Q6ZVU0 165 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 MON1BQ7L1V2 547 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 NTAN1Q96AB6 310 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 CCDC114Q96M63 670 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 IL21RQ9HBE5 538 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 A0A0D9SEW6 157 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SMTNL1A8MU46 457 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FLRT2O43155 660 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 DFNA5O60443 496 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SNAP91O60641 907 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SRGAP2O75044 1071 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 MT-CO1P00395 513 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 NUDT1P36639 197 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 CTSKP43235 329 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 NUMBP49757 651 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 HDAC4P56524 1084 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SLC20A2Q08357 652 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FOXC1Q12948 553 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 GLRX5Q86SX6 157 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SKA1Q96BD8 255 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 AGPAT1Q99943 283 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SYT11Q9BT88 431 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SARDHQ9UL12 918 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 KNL1Q8NG31 2342 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 PCDHGA12O60330 932 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ZMPSTE24O75844 475 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ETFBP38117 255 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 MAPKAPK2P49137 400 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FAM193AP78312 1265 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 GNA12Q03113 381 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SCAPQ12770 1279 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 CDO1Q16878 200 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 AGBL4Q5VU57 503 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 RETSATQ6NUM9 610 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 WDR59Q6PJI9 974 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 TMIEQ8NEW7 156 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OR7D4Q8NG98 312 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 BAP1Q92560 729 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SLC6A18Q96N87 628 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 CEP44Q9C0F1 390 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 EBF2Q9HAK2 575 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 NEU3Q9UQ49 428 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 A0A1W2PQC6 194 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ANKRD62A6NC57 917 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 K7ERQ8 282 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 GJB6O95452 261 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 RHOQP17081 205 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 GPD1P21695 349 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 RRM1P23921 792 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-207ENST00000486975 ZNF165P49910 485 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms