RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ACOX2	Q99424	681 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GABRG3	Q99928	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANK1	P16157	1881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LRBA	P50851	2863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	VILL	O15195	856 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SGSM2	O43147	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	EDIL3	O43854	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OPA1	O60313	960 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TULP3	O75386	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	FUCA1	P04066	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TYMP	P19971	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CD27	P26842	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LIFR	P42702	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF132	P52740	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	STARD3	Q14849	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	EPHA7	Q15375	998 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LXN	Q9BS40	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CIT	O14578	2027 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C7orf72	A4D263	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MTSS1	O43312	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PRC1	O43663	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NPHS1	O60500	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TADA3	O75528	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PAM	P19021	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MCM5	P33992	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MCM7	P33993	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	STAT5A	P42229	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SEPHS1	P49903	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	BCAT1	P54687	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NLRP5	P59047	1200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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