RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SERAC1Q96JX3 654 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf74Q96LT6 269 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PSMB7Q99436 277 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MPP6Q9NZW5 540 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 VPS51Q9UID3 782 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CHD6Q8TD26 2715 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GTQ1 180 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1W2PR77 199 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DRGXA6NNA5 263 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 LATO43561 262 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SRGAP2O75044 1071 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MT-CO1P00395 513 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 WNT1P04628 370 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 OR1E1P30953 314 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SOX5P35711 763 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FMO1Q01740 532 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CNTN1Q12860 1018 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 AGBL4Q5VU57 503 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ARCQ7LC44 396 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 BNIPLQ7Z465 357 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FAM131BQ86XD5 332 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 EMC1Q8N766 993 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 HAPLN3Q96S86 360 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GDF3Q9NR23 364 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FANCLQ9NW38 375 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0D9SEW6 157 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 WNT9AO14904 365 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 EPHB6O15197 1021 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 YKT6O15498 198 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TNFSF14O43557 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MMP8P22894 467 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 RRM1P23921 792 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NUDT1P36639 197 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CLCN6P51797 869 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 JAM2P57087 298 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ATP11AP98196 1134 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CDO1Q16878 200 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 LINGO4Q6UY18 593 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM69Q86WT6 500 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ILVBLA1L0T0 632 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 K7ERQ8 282 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CBFA2T2O43439 604 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CHRNB2P17787 502 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SDC4P31431 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CHRNA3P32297 505 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 STAT1P42224 750 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NXPH1P58417 271 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FANCCQ00597 558 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SYCP1Q15431 976 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NEK11Q8NG66 645 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 OR7D4Q8NG98 312 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SPON2Q9BUD6 331 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PREBQ9HCU5 417 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DYRK4Q9NR20 520 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DMTF1Q9Y222 760 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 LGALS16A8MUM7 142 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TLR4O00206 839 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CBX4O00257 560 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms