RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	GALNT16	Q8N428	558 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	SYT17	Q9BSW7	474 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	VPS4A	Q9UN37	437 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	TAF1	P21675	1872 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	CACNA1S	Q13698	1873 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722		A0A0D9SFI3	127 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	GPAA1	O43292	621 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	GLP2R	O95838	553 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	PRR35	P0CG20	571 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MMP8	P22894	467 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MECOM	Q03112	1051 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	SLC14A1	Q13336	389 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	KRT32	Q14532	448 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	TNIP1	Q15025	636 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	TEKT1	Q969V4	418 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
SCIN-205	ENST00000473722	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		5.84	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GAK	O14976	1311 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PCDH17	O14917	1159 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DHH	O43323	396 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MBD4	O95243	580 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	KEL	P23276	732 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PSMA5	P28066	241 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CSHL1	Q14406	222 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	OLFM4	Q6UX06	510 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MYH7	P12883	1935 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DSCR3	O14972	297 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FFAR2	O15552	330 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ALAD	P13716	330 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NPPB	P16860	134 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MATN1	P21941	496 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DUSP1	P28562	367 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	HSPA4	P34932	840 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TNFAIP2	Q03169	654 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	BECN1	Q14457	450 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RABEP1	Q15276	862 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SEC23B	Q15437	767 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ALX1	Q15699	326 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CNGA3	Q16281	694 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48

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